Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL1Q92935 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms