Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF3Q92576 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms