Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC12Q8WUD4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms