Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH3Q8TBE1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms