Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms