Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A9Q8NBW4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms