Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.2 ms