Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GCSAMQ8N6F7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms