Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG6Q86US8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms