Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms