Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms