Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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