Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf39Q6ZRI6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms