Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms