Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms