Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMPD1Q5SYB0 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms