Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms