Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms