Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 Z95114.4-201ENST00000623420 3578 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 USP32P3-201ENST00000413270 1174 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 NAA60-220ENST00000573580 758 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C4orf48Q5BLP8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms