Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms