Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms