Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms