Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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