Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms