Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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