Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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