Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms