Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms