Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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