Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms