Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NCOA4Q13772 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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NCOA4Q13772 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCOA4Q13772 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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