Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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