Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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