Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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