Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

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Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRSQ13332 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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