Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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