Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms