Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms