Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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