Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms