Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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