Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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SYCNQ0VAF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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