Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms