Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms