Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms