Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms