Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms