Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms