Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms