Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms